Je ne comprends absolument rien à tes problèmes!!

Pour les clonages j'ai toujours utilisé un vieil GHOST dont j'ai le CD 
bootable qui me copie partition (ou disque) sur partition (ou disque), 
je rend la partition ad hoc "active" et cela repart toujours sans 
BSOD..

Il me semble que Gparted et consort font strictement la même chose, 
mais effectivement si tu veux faire des manip sous Windows, bonjour les 
dégats car il faut modifier des données, table des partition par 
exemple, que Windows n'aime pas qu'on y touche ... quand à le faire au 
redémarrage, tu reviens à la manip du CD bootable, en plus compliqué 
sans doute!!

Quand à Ghost et autres CD bootables, ils se foutent de ce qu'il y a 
sur le DD, ils copient des bits secteur par secteur .... Et dans les 
années 70 je faisais déjà cela sur des machines "haut de gamme" dont 
les performances étaient inférieures à une calculette scientifi que 
actuelle, mais les principes sont les mêmes!

De même des sauvegardes avec le même logiciel sont faites sans 
problème, et restuées de même que ce soit une partiton Windows, Linux 
etc; pour Windows faut seulement faire gaffe que la lettre des 
partitions soit la bonne sinon y a comme un défaut!!

Mais pourquoi faire simple si compliqué marche aussi!!

Sur ce bonne continuation

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